哥伦比亚武装部队的最高指挥官是共和国总统，这是宪法规定的，也是命令。 在当前针对哥伦比亚的侵略时期，关于情报机构之间协作的可能性，确实已经在军事和警察高层中进行了讨论。尤其是当一些机构成员并未采取行动打击毒贩，而是针对总统、他的家人以及他的政治立场时，这超出了他们在哥伦比亚的职能范围，并直接侵犯了国家主权。